新西兰国旗和澳大利亚国旗的区别是：花纹不同、星星位置不同、含义不同、确立时间不同。

1、花纹不同。新西兰国旗上是四颗镶白边的红色五角星，澳大利亚国旗上是六颗白色的七角星。

2、星星位置不同。新西兰国旗上的五角星在右边，而澳大利亚国旗上的七角星有一个大的是在米字下方的，剩下四颗七角星和一颗五角星在国旗的右边。

3、含义不同。新西兰国旗的五角星表示南十字星座，象征独立和希望。澳大利亚国旗上，最大的一颗七角星象征组成澳大利亚联邦的六个州和两个联邦领地，五颗小星表示南十字星座。

4、确立时间不同。现今的新西兰国旗是在1902年新西兰政府通过国旗法案，经英王爱德华七世批准正式成为新西兰国旗。而现今的澳大利亚国旗则是在1903年，从三万多个作品中选出来的。